尼日利亚于1995年3月1日建立了有5147个组成的关税体系。在该体系中，进口关税介于5%-60%之间。2000年平均关税从24%降至 12%，2001年，对500项关税进行了修改，其中70项(大多数为农产品)平均上调至25%，430项平均降至10%以下，因而关税总平均水平有所下降。进口关税由尼日利亚海关征收，政府制定会计/审计事务所协作，经由指定商业银行缴付至联邦政府。
